如何選擇一臺稱心的全自動凝膠成像分析系統(tǒng)
全自動凝膠成像分析系統(tǒng)幾乎是每個分子生物學(xué)實驗室的必需品。幾十年來,凝膠成像的設(shè)備已經(jīng)從簡單的紫外線和寶麗來相機(jī)發(fā)展到的數(shù)字化數(shù)據(jù)采集和分析系統(tǒng)。它的用途是從瓊脂糖或聚丙烯酰胺凝膠上分離的DNA中獲取信息。
據(jù)介紹,目前很難研究市場,并確定誰是全自動凝膠成像分析系統(tǒng)的客戶,因為這個系統(tǒng)的應(yīng)用如此廣泛。“這是一種無處不在的技術(shù)。如果你身處生命科學(xué)領(lǐng)域,你就需要用到全自動凝膠成像分析系統(tǒng)。”
在此,我們就介紹一些選購時的重要考慮因素,包括多功能、靈敏度、動態(tài)范圍和易用程度。
靈敏度和動態(tài)范圍
盡管一些DNA成像應(yīng)用只需要粗略的測定或“有沒有”的結(jié)果,但大多數(shù)的研究人員還是希望獲得*的數(shù)據(jù)質(zhì)量。在選購全自動凝膠成像分析系統(tǒng)時,靈敏度和動態(tài)范圍往往是兩個重要的考慮因素。
很多人認(rèn)為,相機(jī)分辨率是評估系統(tǒng)靈敏度的*參數(shù),但事實上,靈敏度是通過大的鏡頭光圈、出色的低噪聲相機(jī)、電子噪聲的進(jìn)一步深度冷卻以及樣品與光圈的zui近距離來實現(xiàn)的。拼接(binning)的做法可能犧牲CCD相機(jī)的分辨率。它允許在圖像捕獲時收集更多的光,但通過降低像素總數(shù)來降低總的分辨率。
靈敏度是開發(fā)全自動凝膠成像分析系統(tǒng)時優(yōu)先考慮的事情。
成像系統(tǒng)的進(jìn)步包括“更靈敏的相機(jī)和光學(xué)元件,以及一鍵式的圖像捕獲和分析自動化”。
動態(tài)范圍與靈敏度密切相關(guān)。動態(tài)范圍寬,全自動凝膠成像分析系統(tǒng)則意味著在同一幅圖像中可檢測到低水平和高水平的樣品。對于某些應(yīng)用而言,動態(tài)范圍是重要的考慮因素,例如監(jiān)控刺激化合物的影響或抑制劑對表達(dá)的影響。
多功能
盡管一臺簡單、的全自動凝膠成像分析系統(tǒng)似乎是一個不錯的選擇,但大多數(shù)客戶感興趣的是多功能的系統(tǒng),這指的是所分析的凝膠類型、檢測方法和應(yīng)用范圍。為此,許多制造商生產(chǎn)出多功能的儀器,如多重?zé)晒鈾z測、兼容比色樣品,甚至有更多的應(yīng)用,如Western分析或組織切片分析。
全自動凝膠成像分析系統(tǒng)安全性和易用性
目前市場上有一個趨勢,就是凝膠成像的自動化。這意味著,你只要將凝膠放入系統(tǒng)中,按下按鈕就能完成分析。大多數(shù)系統(tǒng)提供一定程度的自動化。
用戶考慮的另一個因素是安全性,這主要涉及到EB的使用。大家都知道,EB是誘變劑,需要特殊處理。平時,人們都會使用手套、防護(hù)設(shè)備,并防止儀器被EB污染。如今,許多更安全的染料可用于DNA凝膠,而儀器制造商也對成像系統(tǒng)進(jìn)行了相應(yīng)的優(yōu)化,以支持這些更安全的選擇。
全自動凝膠成像分析系統(tǒng)易用性包括大部分凝膠成像工作的自動化,比如縮放和對焦。
如今,DNA全自動凝膠成像分析系統(tǒng)的市場十分成熟,也充滿競爭,在每個價格點都有多個選擇??偟膩碚f,個體需求和具體應(yīng)用始終是首要的考慮因素,比如儀器在特定染料上的表現(xiàn)及檢測方法的切換能力。人們也許很難找到儀器在特定應(yīng)用中的一對一比較數(shù)據(jù),因此需要密切留意產(chǎn)品資料,并與銷售代表溝通。當(dāng)然,這個全自動凝膠成像分析系統(tǒng)應(yīng)當(dāng)是面向未來的,考慮到現(xiàn)在及將來的需求。